ในประมาณ 10 เปอร์เซ็นต์ของกรณีแพทย์ไม่สามารถแยกความแตกต่างระหว่างลำไส้ใหญ่อักเสบเป็นแผลเป็นและลำไส้ใหญ่อักเสบของ Crohn ได้ ผู้ป่วยมีลักษณะของทั้งสองโรคและมักไม่มีหลักฐานที่น่าสนใจสำหรับโรคอย่างใดอย่างหนึ่ง ผู้ป่วยที่ถูกจัดว่าเป็น "ลำไส้ใหญ่ที่ไม่แน่นอน"
น่าสนใจเมื่อเวลาผ่านไปผู้ป่วยส่วนใหญ่ที่มีอาการลำไส้ใหญ่บึกบ่องไม่แน่นอนจะพบว่ามีโรค Crohn ที่แน่ชัด การระบุปัจจัยที่เฉพาะเจาะจงซึ่งอาจเป็นตัวกำหนดความรุนแรงของโรคนั้นเป็นคำถามที่ใช้งานได้จริงซึ่งยังคงไม่ได้รับคำตอบ